１号ドックに続いて、明治7(1874)年に３号ドック(96ｍ)、明治17(1884)年に２号ドック(151ｍ)と建設され、艦船大型化の流れの中で明治38(1901)年４号ドック(240ｍ)、大正６(1916)年５号ドック(324ｍ)、昭和10（1935）年６号ドック(366ｍ)と作られていく。完成以来140年を迎えた１号ドックから77年経った６号ドックまで、現在も使用されており、特に石づくりの１－３号ドックは当時の日本の技術を検証する国宝級の産業遺産である。
なお、最も長い２号ドックを真ん中に配置したのは、もっぱら両側にある１号、３号ドックの排水ポンプを活用して、長いドックの排水効率を向上させる工夫である。 横須賀製鉄所はヴェルニーの指導で作ったフランスの技術を集めた最新の造船所で、日本人が設備を使いこなせるように、先行して横浜製鉄所（(五) 横浜製鉄所――横浜につくられた日本初の洋式工場）を作り、横須賀製鉄所で使用する設備を製作しながら、フランス語と機械加工技術・造船技術を訓練した。
明治４（1871）年、横須賀造船所と改名。翌年、明治５(1872)年には海軍省主船寮が主管になる。ここで、待望の軍艦第１号「清輝」(せいき：897トン、全長61メートル)を完成。清輝は西欧の軍艦には及ばないが、それでも自前で軍艦を建造できたのは大きな成果で、進水式には明治天皇も臨席している。この船は日本の艦船として初めてヨーロッパへ遠征している。技術力を誇示するためのお披露目というところか。
明治８(1875)年には、海軍がイギリスの指導を受けるようになり、軍政がイギリス式に変わったことで、ヴェルニーを解雇。イギリス人技師２名を採用する。
こんな中で、明治９(1877)年２月には砲艦「磐城」（1464トン、350馬力）、３月には国産第3艦「天城」を進水させる。天城は938トン、720馬力、乗員160名。クルップ式の砲門を備えた３本マストの国産初の巡洋艦だった。フランス人技術者なしで、軍船を建造できるまでになっていた習得力の速さは注目に値する。
この後、造船所は、明治17(1884)年には横須賀鎮守府直轄に、そして明治35(1903)年には横須賀海軍工廠となり、大型軍艦の建造に一直線に進む。

＊この記事中の１０行目に
「先行して横浜製鉄所（(五) 横浜製鉄所――横浜につくられた日本初の洋式工場）を作り、とあります。ここは、次項の「3-4横浜製鉄所」をリンクしてください。

３つのドックの位置関係。それぞれ間にポンプ小屋があり、両方で使えるようになっている（季刊「大林」より）。

造船台上の「清輝」の竜骨（『日仏文化交流写真集・第１集』駿河台出版社）。

「天城」の進水式（1877.03.13）。清輝級スループの拡大改良型で船材の多くは天城山で伐採したものを使用。完成は翌1878年04月04日（『日仏文化交流写真集・第１集』駿河台出版社）。